Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ECHS1P30084 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms