Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRZ1P23471 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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