Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPRBP23467 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRBP23467 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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PTPRBP23467 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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