Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 TMEM64-206ENST00000521852 587 ntTSL 417.71■□□□□ 0.431e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.41e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 PC-211ENST00000530259 906 ntTSL 516.49■□□□□ 0.231e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 SLC38A10-206ENST00000540966 896 ntTSL 316.3■□□□□ 0.21e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.151e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 COL4A5-203ENST00000470339 782 ntTSL 315.03■□□□□ -01e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 SLC38A10-211ENST00000576151 774 ntTSL 214.97□□□□□ -0.011e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)14.53□□□□□ -0.081e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ACP2-213ENST00000534448 2170 ntTSL 514.46□□□□□ -0.11e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.11e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ACP2-210ENST00000531004 1457 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 UXS1-210ENST00000473338 1547 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.151e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 NINJ1-203ENST00000470314 834 ntTSL 313.61□□□□□ -0.231e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 NINJ1-202ENST00000461162 861 ntTSL 213.38□□□□□ -0.271e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)13.29□□□□□ -0.281e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 TAP2-204ENST00000485701 274 ntTSL 313.15□□□□□ -0.31e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.351e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CHID1-224ENST00000534254 1019 ntTSL 512.87□□□□□ -0.351e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.364e-7■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ACP2-204ENST00000525230 756 ntTSL 212.68□□□□□ -0.381e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CHID1-219ENST00000531859 834 ntTSL 512.6□□□□□ -0.391e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.44e-7■■□□□ 14.1
RPS3P23396 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CHID1-204ENST00000449825 3537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.61e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 USP11-208ENST00000480104 697 ntTSL 310.64□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 510.59□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 LEPROT-204ENST00000488747 345 ntTSL 510.54□□□□□ -0.721e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 NINJ1-205ENST00000490564 488 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.781e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CHID1-207ENST00000524832 878 ntTSL 210.06□□□□□ -0.81e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ACP2-214ENST00000534752 274 ntTSL 59.34□□□□□ -0.911e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 STIM1-204ENST00000525403 625 ntTSL 47.38□□□□□ -1.231e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 UXS1-215ENST00000497604 2907 ntTSL 26.98□□□□□ -1.291e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.61e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 SLC11A2-218ENST00000549193 557 ntTSL 44.11□□□□□ -1.751e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 AC140504.1-201ENST00000568766 498 ntAPPRIS P1 TSL 222.84■■□□□ 1.259e-8■■□□□ 14.1
RPS3P23396 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.729e-8■■□□□ 14.1
RPS3P23396 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.249e-8■■□□□ 14.1
RPS3P23396 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.381e-7■■□□□ 14.1
RPS3P23396 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.291e-7■■□□□ 14.1
RPS3P23396 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.181e-7■■□□□ 14.1
RPS3P23396 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.511e-7■■□□□ 14.1
RPS3P23396 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.181e-7■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.552e-14■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ATP5L-204ENST00000529460 457 ntTSL 310.97□□□□□ -0.652e-14■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ATP5L-207ENST00000533172 336 ntTSL 29.57□□□□□ -0.882e-14■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ATP5L-202ENST00000524422 720 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.012e-14■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ATP5L-205ENST00000529770 575 ntTSL 27.05□□□□□ -1.282e-14■■□□□ 14.1
RPS3P23396 ATP5L-206ENST00000529790 900 ntTSL 25.83□□□□□ -1.482e-14■■□□□ 14.1
RPS3P23396 F11-206ENST00000503841 563 ntTSL 213.38□□□□□ -0.273e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 F11-201ENST00000264691 670 ntTSL 310.98□□□□□ -0.653e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 F11-203ENST00000403665 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.743e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 F11-202ENST00000264692 1916 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.93e-6■■□□□ 14.1
RPS3P23396 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.326e-7■■□□□ 14.1
RPS3P23396 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.16e-7■■□□□ 14.1
RPS3P23396 TPI1-208ENST00000495834 820 ntTSL 211.27□□□□□ -0.618e-13■■□□□ 14.1
RPS3P23396 TPI1-203ENST00000462761 374 ntTSL 310.7□□□□□ -0.78e-13■■□□□ 14.1
RPS3P23396 HMGCS1-207ENST00000514610 555 ntTSL 20.62□□□□□ -2.312e-15■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CANX-208ENST00000504579 533 ntTSL 422.24■■□□□ 1.154e-13■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CANX-217ENST00000513246 727 ntTSL 517.6■□□□□ 0.413e-13■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CANX-204ENST00000502498 570 ntTSL 416.81■□□□□ 0.284e-13■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CANX-219ENST00000514383 585 ntTSL 316.81■□□□□ 0.284e-13■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CANX-203ENST00000502296 825 ntTSL 414.92□□□□□ -0.024e-13■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CANX-216ENST00000510810 511 ntTSL 414.54□□□□□ -0.084e-13■■□□□ 14.1
RPS3P23396 FTH1-204ENST00000529548 567 ntTSL 39.89□□□□□ -0.831e-9■■□□□ 14.1
RPS3P23396 AURKB-213ENST00000584972 739 ntTSL 310.48□□□□□ -0.739e-7■■□□□ 14.1
RPS3P23396 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.194e-11■■□□□ 14.1
RPS3P23396 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.144e-11■■□□□ 14.1
RPS3P23396 UBQLN1-205ENST00000529923 471 ntTSL 22.44□□□□□ -2.024e-11■■□□□ 14.1
RPS3P23396 APLP2-215ENST00000530493 1322 ntTSL 210.64□□□□□ -0.712e-11■■□□□ 14.1
RPS3P23396 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.566e-9■■□□□ 14
RPS3P23396 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.416e-9■■□□□ 14
RPS3P23396 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 512.81□□□□□ -0.366e-9■■□□□ 14
RPS3P23396 STPG4-206ENST00000422269 983 ntTSL 211.02□□□□□ -0.656e-9■■□□□ 14
RPS3P23396 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.946e-9■■□□□ 14
RPS3P23396 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 22.29□□□□□ -2.046e-9■■□□□ 14
RPS3P23396 ACTN1-214ENST00000555075 828 ntTSL 311.82□□□□□ -0.521e-7■■□□□ 14
RPS3P23396 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.079e-7■■□□□ 14
RPS3P23396 TIMM50-209ENST00000597666 604 ntTSL 320.85■□□□□ 0.939e-7■■□□□ 14
RPS3P23396 TIMM50-218ENST00000602028 770 ntTSL 520.85■□□□□ 0.939e-7■■□□□ 14
RPS3P23396 TIMM50-216ENST00000601358 1481 ntTSL 1 (best)20.41■□□□□ 0.869e-7■■□□□ 14
RPS3P23396 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.729e-7■■□□□ 14
RPS3P23396 TIMM50-217ENST00000601403 769 ntTSL 518.57■□□□□ 0.569e-7■■□□□ 14
RPS3P23396 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.39e-7■■□□□ 14
RPS3P23396 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.19e-7■■□□□ 14
RPS3P23396 TIMM50-219ENST00000602265 786 ntTSL 212.67□□□□□ -0.389e-7■■□□□ 14
RPS3P23396 TGFBR3-203ENST00000417833 551 ntTSL 412.93□□□□□ -0.342e-9■■□□□ 14
RPS3P23396 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.247e-10■■□□□ 14
RPS3P23396 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.787e-10■■□□□ 14
RPS3P23396 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.951e-6■■□□□ 14
RPS3P23396 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.581e-6■■□□□ 14
RPS3P23396 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-6■■□□□ 14
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