Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRHP20396 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRHP20396 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRHP20396 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRHP20396 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRHP20396 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRHP20396 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRHP20396 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRHP20396 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRHP20396 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
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