Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTPS1P17812 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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