Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms