Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CREB1P16220 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CREB1P16220 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CREB1P16220 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CREB1P16220 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CREB1P16220 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CREB1P16220 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CREB1P16220 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CREB1P16220 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms