Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP2AP11388 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOP2AP11388 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms