Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF254O75437 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms