Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NOL3O60936 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NOL3O60936 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NOL3O60936 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms