Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
XRCC2O43543 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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