Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRTO14522 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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