Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC01387J3KSC0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC01387J3KSC0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms