Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPA2E9PIF3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms