Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ERVV-2B6SEH9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ERVV-2B6SEH9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms