Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOBPA7XYQ1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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