Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SRRM4A7MD48 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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