Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C4orf47A7E2U8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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