Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TVP23AA6NH52 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TVP23AA6NH52 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms