Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms