Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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HECTD4Q9Y4D8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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HECTD4Q9Y4D8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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HECTD4Q9Y4D8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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HECTD4Q9Y4D8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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HECTD4Q9Y4D8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
HECTD4Q9Y4D8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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