Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SHANK2Q9UPX8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms