Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK1Q9UPV9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms