Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP18Q9UMW8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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