Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB23Q9ULC3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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