Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms