Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PEMTQ9UBM1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms