Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KLHL42Q9P2K6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms