Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHL9Q9P2J3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms