Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CNTN3Q9P232 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CNTN3Q9P232 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms