Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC88CQ9P219 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms