Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HCN3Q9P1Z3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms