Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MIS18AQ9NYP9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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