Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms