Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB6BQ9NRW1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms