Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ASCL3Q9NQ33 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms