Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FANCFQ9NPI8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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