Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TMEM27Q9HBJ8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TMEM27Q9HBJ8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TMEM27Q9HBJ8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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