Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSPNQ9HAW4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms