Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP13A3Q9H7F0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms