Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC39A8Q9C0K1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms