Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
SNHG12Q9BXW3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms