Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCP2Q9BX26 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms