Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
KATNB1Q9BVA0 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KATNB1Q9BVA0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms