Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C9orf16Q9BUW7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms