Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RSG1Q9BU20 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms