Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms