Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FYCO1Q9BQS8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FYCO1Q9BQS8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms