Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CGREF1Q99674 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CGREF1Q99674 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms